一般認(rèn)為廢水中的致病微生物有細(xì)菌、病毒、立克次氏體、原生動(dòng)物和真菌等五種，立克次氏體介于細(xì)菌和病毒之間，一些微生物學(xué)家把以致梅毒體為代表的致病螺旋體歸納為第六種致病微生物，而螺旋體介于細(xì)菌和原生動(dòng)物之間。有些高于原生動(dòng)物的微生物，如線蟲也能致病。生活污水及屠宰、生物制品、醫(yī)院、制革、洗毛等工業(yè)廢水中常含有這些能傳染各種疾病的致病微生物。
對(duì)致病病原體較為集中和含量較大的污水最好進(jìn)行單獨(dú)消毒處理，然后再和其他污水一起進(jìn)行二級(jí)生化處理，這樣可以減少消毒劑的消耗量。因?yàn)椴≡w在水中的存活時(shí)間較長(zhǎng)，有的病毒和寄生蟲卵用一般的消毒方法難以殺死。
消毒殺菌的方法有氯、二氧化氯、臭氧等氧化法、石灰處理、紫外線照射、加熱處理、超聲波等，另外超濾處理也可以除去水中大部分的細(xì)菌。就細(xì)菌、病毒的去除而言，臭氧氧化、紫外線照射等方法效果很好，但處理后的水中沒有類似余氯的剩余消毒劑，無(wú)法防止微生物的再繁殖，通常需要在處理后再補(bǔ)充加氯處理。
